Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKL1Q969V6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms