Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS3Q969F9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS3Q969F9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms