Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF3C6Q969F1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF3C6Q969F1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF3C6Q969F1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms