Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLP1Q92989 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLP1Q92989 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms