Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEO1Q92859 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEO1Q92859 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEO1Q92859 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms