Protein–RNA interactions for Protein: Q92771

DDX12P, Putative ATP-dependent RNA helicase DDX12, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX12PQ92771 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX12PQ92771 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX12PQ92771 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms