Protein–RNA interactions for Protein: Q92766

RREB1, Ras-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RREB1Q92766 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RREB1Q92766 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RREB1Q92766 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RREB1Q92766 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RREB1Q92766 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms