Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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C15orf40Q8WUR7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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C15orf40Q8WUR7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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C15orf40Q8WUR7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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C15orf40Q8WUR7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C15orf40Q8WUR7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C15orf40Q8WUR7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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