Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA3Q8TBC4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms