Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PIK3C3Q8NEB9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms