Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDPRQ8NCN5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms