Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87AQ8NBN3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms