Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM229BQ8NBD8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms