Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms