Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00612Q8N6U2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00612Q8N6U2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00612Q8N6U2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00612Q8N6U2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00612Q8N6U2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00612Q8N6U2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00612Q8N6U2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00612Q8N6U2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms