Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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CLDN19Q8N6F1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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CLDN19Q8N6F1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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CLDN19Q8N6F1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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CLDN19Q8N6F1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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CLDN19Q8N6F1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLDN19Q8N6F1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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