Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PASD1Q8IV76 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms