Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRTM3Q86VH5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms