Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO2Q7Z6W1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO2Q7Z6W1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms