Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GDPD3Q7L5L3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GDPD3Q7L5L3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms