Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BEND4Q6ZU67 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms