Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms