Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms