Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms