Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHISA2Q6UWI4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms