Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOA5Q6Q788 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms