Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms