Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC41PQ6P2S7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC41PQ6P2S7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms