Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms