Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPATA1Q5VX52 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPATA1Q5VX52 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATA1Q5VX52 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms