Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRCH2Q5VUJ6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms