Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf135Q5VTT2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf135Q5VTT2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms