Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF38BQ5VTL8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms