Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCID2Q5JVF3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms