Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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C9orf116Q5BN46 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf116Q5BN46 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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