Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN4Q5BKX8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN4Q5BKX8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms