Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGO2Q562F6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms