Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6CQ53S08 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms