Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP28Q4G0W2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms