Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF3Q3KNV8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCGF3Q3KNV8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms