Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NBPF1Q3BBV0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NBPF1Q3BBV0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NBPF1Q3BBV0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF1Q3BBV0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF1Q3BBV0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF1Q3BBV0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF1Q3BBV0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF1Q3BBV0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF1Q3BBV0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF1Q3BBV0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF1Q3BBV0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF1Q3BBV0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF1Q3BBV0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF1Q3BBV0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms