Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TYSND1Q2T9J0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms