Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q1T7F1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q1T7F1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q1T7F1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q1T7F1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Q1T7F1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Q1T7F1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q1T7F1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q1T7F1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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