Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTF1Q16619 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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