Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SGCAQ16586 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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