Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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MRPL23Q16540 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL23Q16540 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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