Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TNXAQ16473 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TNXAQ16473 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TNXAQ16473 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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TNXAQ16473 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNXAQ16473 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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