Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD5Q16401 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD5Q16401 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD5Q16401 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMD5Q16401 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD5Q16401 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD5Q16401 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD5Q16401 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD5Q16401 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD5Q16401 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMD5Q16401 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms