Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms