Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USF2Q15853 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USF2Q15853 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USF2Q15853 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USF2Q15853 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USF2Q15853 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USF2Q15853 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USF2Q15853 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF2Q15853 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF2Q15853 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF2Q15853 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF2Q15853 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF2Q15853 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF2Q15853 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF2Q15853 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USF2Q15853 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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